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木聚糖酶可以应用在酿造、饲料工业中。木聚糖酶可以分解酿造或饲料工业中的原料细胞壁降低酿造中物料的粘度，促进有效物质的释放，以及降低饲料用粮中的非淀粉多糖，促进营养物质的吸收利用，并因而更易取可溶性脂类成分。
木聚糖酶应用pH范围3.5～6.0,适宜温度范围40℃～60℃，并能耐受高温制粒的温度及分钟。
可在糖化过程蛋白质休止期或后发酵中添加。通常为25~75 g/吨麦汁或发酵液汁。佳用量应通过实验决定。
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